Первым делом вам нужно написать официальное письмо в ваш университет с просьбой о том, чтобы приемная комиссия обратилась в посольство и попросила ускорить процесс рассмотрения документов.
Если этот шаг не поможет, то вам нужно заранее позаботиться о том, чтобы у вас была открыта Шенгенская виза в любую другую страну ЕС. По этой визе вы можете находиться в Австрии до 3-х месяце
Таким образом, подав документы в сентябре на студенческую визу, вы едите в Австрию по туристической и параллельно ждете ответа по визе D. После получения ответа вы летите в посольство в Москве (или другом городе, в зависимости от страны), ставите уже студенческую визу и возвращаетесь в Вену.